Le salaire d'un alternant est fixé en pourcentage du salaire minimum de croissance, ou du minimum conventionnel de branche s'il est plus favorable. Deux variables le déterminent : l'âge et l'année d'exécution du contrat.
La grille progresse par tranches d'âge, moins de 18 ans, de 18 à 20 ans, de 20-et-un à 25 ans, 26 ans et plus, et par année de contrat, première, deuxième, troisième. Le pourcentage augmente à chaque franchissement. À 26 ans et au-delà, l'apprenti perçoit au minimum le salaire minimum entier, ou le minimum conventionnel s'il est supérieur.
Le passage à une tranche d'âge supérieure prend effet le premier jour du mois suivant l'anniversaire. Ce point est fréquemment oublié par les employeurs et constitue un motif courant de régularisation de salaire.
La grille est plus simple : un pourcentage selon l'âge et le niveau de qualification préalable pour les moins de 26 ans, et au minimum le salaire minimum ou 85 % du minimum conventionnel pour les 26 ans et plus.
Le salaire de l'apprenti est exonéré d'impôt sur le revenu dans la limite du salaire minimum annuel. Les cotisations salariales sont réduites en dessous d'un certain seuil de rémunération. Ces avantages ne s'appliquent pas de la même manière au contrat de professionnalisation, différence à connaître avant de comparer deux propositions.
L'alternant a droit aux titres restaurant, à la prise en charge des transports et aux avantages du comité social et économique dans les mêmes conditions que les autres salariés. Les heures de formation sont du temps de travail effectif et rémunérées comme telles, y compris lorsqu'elles se déroulent hors de l'entreprise.